Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fchsd2Q3USJ8 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fchsd2Q3USJ8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms