Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Trafd1Q3UDK1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms