Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Q3U595 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Q3U595 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms