Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

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Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LcorlQ3U285 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms