Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Srsf6Q3TWW8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Srsf6Q3TWW8 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms