Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Ccndbp1Q3TVC7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms