Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctdnep1Q3TP92 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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