Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Stat5a-201ENSMUST00000004145 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ddx21-201ENSMUST00000045866 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm20715-201ENSMUST00000054781 4460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hddc2Q3SXD3 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms