Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm42433-201ENSMUST00000196806 940 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Vax1Q2NKI2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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