Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

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Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mir744-201ENSMUST00000103261 100 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm14052-201ENSMUST00000121434 1031 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm17796-201ENSMUST00000189015 1213 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm4930-201ENSMUST00000219926 1087 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Samd11Q1RNF8 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms