Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpusd2Q149F1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm20821-201ENSMUST00000179829 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 9330185C12Rik-201ENSMUST00000180837 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm7441-201ENSMUST00000220697 1074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Manf-201ENSMUST00000069036 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpusd2Q149F1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms