Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Traf3ip1Q149C2 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms