Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atp8b1Q148W0 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atp8b1Q148W0 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atp8b1Q148W0 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atp8b1Q148W0 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Atp8b1Q148W0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Atp8b1Q148W0 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Atp8b1Q148W0 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atp8b1Q148W0 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms