Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 BX649293.1-201ENSMUST00000227437 631 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ift172-206ENSMUST00000201809 405 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Optc-204ENSMUST00000149380 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Gm42875-201ENSMUST00000197674 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lrriq1Q0P5X1 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Lrriq1Q0P5X1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrriq1Q0P5X1 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrriq1Q0P5X1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrriq1Q0P5X1 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm6317-201ENSMUST00000183159 1000 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
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Lrriq1Q0P5X1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lrriq1Q0P5X1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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