Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc21bQ0HA38 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Gm11033-201ENSMUST00000127757 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Ttc21bQ0HA38 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc21bQ0HA38 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Ttc21bQ0HA38 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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