Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

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Length 335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
MestQ07646 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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MestQ07646 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
MestQ07646 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms