Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
AmbpQ07456 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms