Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC124356.1-201ENSMUST00000221469 698 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mptx1-201ENSMUST00000027816 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Defa-ps16-201ENSMUST00000121939 171 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Nf1Q04690 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms