Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cxcr5Q04683 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cxcr5Q04683 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cxcr5Q04683 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cxcr5Q04683 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Cxcr5Q04683 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cxcr5Q04683 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cxcr5Q04683 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cxcr5Q04683 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cxcr5Q04683 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cxcr5Q04683 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
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