Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Bmpr2-201ENSMUST00000087435 12899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Cacna1cQ01815 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms