Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 1700001J11Rik-201ENSMUST00000185917 759 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm29304-201ENSMUST00000186555 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm29223-201ENSMUST00000188867 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Top2aQ01320 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms