Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Itga4Q00651 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 367.8 ms