Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pkp1P97350 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pkp1P97350 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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