Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mesp1P97309 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Hmgn3-203ENSMUST00000185315 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mesp1P97309 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms