Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Otx2P80206 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Otx2P80206 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms