Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vbp1P61759 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm4454-201ENSMUST00000190585 2578 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vbp1P61759 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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