Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Rufy2-204ENSMUST00000131718 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nphp4P59240 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms