Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
RorcP51450 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
RorcP51450 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
RorcP51450 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms