Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr907-201ENSMUST00000052901 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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LtbrP50284 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
LtbrP50284 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms