Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfx1P48377 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rfx1P48377 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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