Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
VdrP48281 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VdrP48281 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VdrP48281 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VdrP48281 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
VdrP48281 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
VdrP48281 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms