Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
ThpoP40226 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
ThpoP40226 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms