Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Nedd1P33215 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nedd1P33215 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms