Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Hoxd8P23463 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
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