Protein–RNA interactions for Protein: P22005

Penk, Proenkephalin-A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PenkP22005 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PenkP22005 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PenkP22005 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PenkP22005 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms