Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Pou3f1P21952 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms