Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SftpcP21841 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SftpcP21841 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms