Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ntf3P20181 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 Gpr37-202ENSMUST00000200812 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ntf3P20181 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms