Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
P20040 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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P20040 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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P20040 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Thbs2-201ENSMUST00000170872 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
P20040 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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