Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NelfeP19426 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms