Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
P18530 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
P18530 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
P18530 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms