Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC115891.3-201ENSMUST00000219161 2472 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm45597-201ENSMUST00000211524 1994 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm15130-201ENSMUST00000132464 663 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Tmprss7-201ENSMUST00000114562 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Hoxb1P17919 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms