Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm26379-201ENSMUST00000178125 138 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gtf2e2-203ENSMUST00000171010 1664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rpl7a-ps12-201ENSMUST00000120384 794 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm11629-201ENSMUST00000123784 384 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm12976-201ENSMUST00000150171 459 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm16280-201ENSMUST00000162458 623 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm31378-201ENSMUST00000213538 267 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Hs1bp3-201ENSMUST00000020927 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm20610-201ENSMUST00000176406 587 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
DmdP11531 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Adgre5-202ENSMUST00000075843 3000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tomm5-203ENSMUST00000107809 738 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gal3st2b-201ENSMUST00000177958 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rwdd2a-203ENSMUST00000185566 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 1700012J22Rik-201ENSMUST00000193492 830 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mir6396-201ENSMUST00000183603 111 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Zfp389-202ENSMUST00000224437 1234 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC164978.2-201ENSMUST00000226645 857 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm4925-202ENSMUST00000168843 1561 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm38348-201ENSMUST00000191718 2273 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 AC132833.1-202ENSMUST00000228875 1690 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Mir3100-201ENSMUST00000174918 65 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm28499-201ENSMUST00000191576 666 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
DmdP11531 Gm32102-201ENSMUST00000196885 241 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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