Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
P10404 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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P10404 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
P10404 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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P10404 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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P10404 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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P10404 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
P10404 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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