Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
H2-Eb1P04230 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms