Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tgfb1P04202 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tgfb1P04202 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms