Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01800 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01800 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01800 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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