Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
DffaO54786 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
DffaO54786 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms