Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms