Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Foxd2O35392 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Foxd2O35392 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms